宝兴县疾病预防控制中心于2003年12月在原宝兴县防疫站的基础上组建而成，是主要从事疾病预防控制与公共卫生技术管理和服务的县级公益一类事业单位。2020年8月整体搬迁至宝兴县灵关镇钟灵大道1号，中心占地面积约3000平方米，业务用房面积约2100㎡，其中检验科用房约1050㎡。中心内设综合办公室、慢病科、结麻科、急传科、免规科、检验科、卫生科、健教科、性艾科、地病科十个科室。其主要职责为：承担全县传染病、寄生虫病、地方病、非传染性疾病等预防与控制；负责突发公共卫生事件和灾害疫情应急处置工作；负责健康危害因素监测与干预工作；承担健康教育工作；负责疾病预防控制技术管理与应用研究指导等工作。

       中心核定编制30人，其中管理岗位6个，专业技术岗位24个。现有在职职工31人(在编30人，临聘人员1人)，其中高级职称4人，本科学历20人。

       检验科有艾滋病初筛、结核病、分子生物学、病原菌等实验室，配置了气相色谱仪、离子色谱仪、全自动核酸提取仪、实时荧光定量PCR仪等设备。

       成功应对了5.12汶川地震、4.20芦山强烈地震、6.1芦山地震、泥石流和洪涝灾害等重大自然灾害，实现了多次灾后无大疫目标。新冠疫情期间，起到疫情防控排头兵、主力军作用。